如何選擇符合實驗要求的核酸染料?
核酸染料是一種靈敏、穩(wěn)定和相對安全的熒光核酸染色試劑,是生物實驗中*的一分子,尤其是在核酸檢測相關(guān)試驗中,所以核酸染料對于分子生物學相關(guān)專業(yè)的學生來說并不陌生,該如何選擇適合自己使用的核酸染料呢?以下從幾個方面來說明:
1、安全性:如果選擇EB替代染料,那么染料的安全性就是一個非常重要的指標。安全性評估主要的檢測有Ames測試、細胞滲透性實驗、染色體畸變和正向突變分析、口服毒性分析等。在安全性方面,具有較多檢測項目和機構(gòu)出具檢測報告的核酸染料,安全性可能會更高;另外在一些報道或?qū)Ρ葦?shù)據(jù)中,我們也可根據(jù)它們可能的原料來判斷它們的安全性。
2、穩(wěn)定性:核酸染料的穩(wěn)定性和在各種條件下的染色效果,會直接影響觀察到的染色結(jié)果。
3、靈敏度:幾乎所有的EB替代染料都其染料的靈敏度至少不低于EB,甚至高于EB,具體到試驗內(nèi)容上,只要不是有特殊的需求,一般都能滿足。
4、遷移率:由于核酸染料最終都會結(jié)合到DNA上,才能通過染料從而對DNA進行分析,這也就意味著如果采用點染法或膠染法進行核酸檢測時,根據(jù)使用的染料不同,核酸染料或多或少會對核酸的遷移率甚至帶型產(chǎn)生影響。
7-AAD,是一種核酸染料,與DNA結(jié)合后可發(fā)出強烈的熒光,其熒光特性與PI相似,可被488nm氬離子激光激發(fā),但其發(fā)射光譜較PI窄,且發(fā)射波長更長,對其他檢測通道的干擾更小,在多色熒光分析中是PI的*替代品,可與多種488激發(fā)光激發(fā)的熒光染料聯(lián)合使用,如FITC,PE等。
另外,7-AAD是一種非滲透性熒光染料。該染料不能透過活細胞的細胞膜,但可穿透膜損傷細胞如晚期凋亡細胞或者壞死細胞的細胞膜并與其內(nèi)的DNA結(jié)合,可用來區(qū)分存活的早期細胞和壞死或晚期凋亡細胞,廣泛用于流式細胞儀。